Explainable Transformer Models for Clinical Prediction Tasks on Structured Electronic Health Records
可解释 Transformer 模型用于结构化电子健康记录的临床预测任务
🧭 结构化 EHR 序列建模 · 可解释性
Sanofi · Carnegie Mellon University
将化验值按百分位分箱离散为 token 并结合 Integrated Gradients,实现 EHR 序列预测与 token 级解释
📌 工作参考价值
- 数值特征离散化:将连续特征(如价格、时长、评分)通过分位数分箱映射为离散 token,既适配 Transformer 输入,又保留相对大小信息,可用于用户行为序列建模。
- 可解释性归因:Integrated Gradients 对输入 token 序列做贡献归因,可用于诊断推荐模型中哪些历史行为或特征驱动了预测,辅助特征筛选和模型审计。
- 预训练 + 微调:在大规模用户序列上预训练通用行为语言模型,再针对具体任务(点击率、转化率)微调,类似 BERT-LER 在 EHR 上的做法。
- 论文是医疗领域,但序列建模和数值编码策略可迁移到电商用户行为序列、广告曝光序列等场景。
动机:结构化 EHR 预测模型往往忽略定量化验信息,且缺乏对输入医疗事件的解释,缺少统一框架。
方法关键点:提出 BERT-LER,基于 BERT 风格,在 7500 万患者去标识化 EHR 数据上预训练和微调。将化验结果按百分位分箱离散为 token,保留分级信息;结合 Integrated Gradients 实现基于输入 EHR 序列的 token 级归因。
结果:在 EHRShot 公共基准和哮喘严重程度进展真实数据上,预测性能与公开基准模型相当,在化验相关任务上常常超过;归因结果与临床已知风险因素一致。架构与解释方法可推广至多个治疗领域。